飛行機の中で真犯人と遭遇したソンムは、急きょ帰国してヨンジュの安全を確認する。車の中でマンガを描き続けたヨンジュは、疲れ果てて自宅で寝込んでいた。マンガを読んだソンムはチョルがヨンジュに託したＵＳＢメモリの内容を確認し、チョルが真犯人を見つけるというハッピーエンドで『Ｗ』を終わらせようと決意する。そんな中、ヨンジュは再びマンガの世界に吸い込まれる。ところが、ヨンジュとの思い出はチョルの記憶から完全に消えていて…。

真犯人はソンムの顔を奪い、テレビ局で銃を乱射する。ヨンジュは再びマンガの世界に移動し、チョルに急かされながら負傷者の手当てをする。しかしヨンジュの記憶を失ったチョルには、彼女が自分を切なそうに見つめる理由がわからない。その後ヨンジュはいつまでも現実に戻ることができず、空腹のあまりソヒの家に忍び込んで…！？ 一方、真犯人の登場により、10年前に検事としてチョルを有罪に追い込んだハン・チョルホ議員は危機に陥るが…。

ヨンジュはチョルの傷を手当てした後、彼にキスをして現実の世界へ戻る。真犯人がソンムを操って『Ｗ』のストーリーを変えたことを知った彼女は、チョルを救うためにマンガの続きを描き始める。ところが、ヨンジュは突然ハン議員の事務室に移動。チョル以外の人物も自分をマンガの世界へ呼べることを知って驚く。『Ｗ』の中ではチョルが指名手配されてからすでに１カ月が経過していた。ヨンジュは田舎に身を隠したチョルに会いに行くが…。

マンガ『Ｗ』を読んだことをヨンジュに明かし、自分の正体を尋ねたチョル。その瞬間、異次元への扉が現れ、チョルはヨンジュと共に現実の世界へ足を踏み入れる。チョルはソンムの作業場で自分の置かれた状況をすべて把握し、タブレット越しに真犯人と対峙して銃を突きつける。しかし、真犯人に主人公の座を奪われたチョルの体は、次第に消滅しつつあった。チョルはヨンジュをデートに誘い、もう一度マンガの続きを描いてほしいと頼むが…。

チョルはスボンと共にマンガ『Ｗ』で描かれた過去のシーンを編集し、新たなストーリーを組み立てる。その内容は、ハン議員が真犯人を始末した後、ハン議員も警察に逮捕されるというものだった。いよいよマンガが完結する日が近づき、ヨンジュは現実の世界でチョルと仲良く暮らす未来を想像しながら幸せな気分に浸る。そんな中、チョルが現実の世界でソヒを目撃するという奇妙な現象が発生。一方、ヨンジュは父が部屋から消えたことに気づくが…。

真犯人に撃たれ、病院に緊急搬送されたヨンジュ。助かる見込みは薄いと医師に宣告されたチョルは、意識不明のヨンジュをマンガの世界に連れていく。しかし、ヨンジュはまもなくチョルの部屋で息を引き取ってしまう。娘の死を知ったソンムは自暴自棄になるが、チョルはマンガを描けばヨンジュを生き返らせることができると彼を説得する。チョルは複製されたソンムのタブレットがマンガの中にあると確信し、ハン議員の事務室に忍び込むが…。

ヨンジュはホテルの前でチョルの帰りを待つが、いつまで経っても彼は現れない。マンガの世界ではヨンジュが撃たれてから約1年が経過していた。ヨンジュは偶然通りかかったソヒからチョルが逮捕されたことを聞き、裁判を傍聴してチョルと再会する。チョルは死刑を宣告されるが、突如現れた手錠のカギと銃を使って脱走。チョルとヨンジュは現実の世界に戻るため、今度こそハッピーエンドでマンガ『W』の最終回を完結させようとするが…。

『Ｗ』が完結すれば、チョルかソンムのどちらかを失うことになると知ったヨンジュ。身を引く覚悟をしたチョルは、自分とヨンジュの指から結婚指輪を外し、ヨンジュに決断を迫る。ヨンジュは２人を生かすためにこのままマンガの世界に残ると答え、チョルに反対されるが…。そんな中、チョルは監禁されたドユンを救い出すが、ハン議員に撃たれて重傷を負う。チョルから電話を受けたヨンジュは、彼が待つバス停に急いで車を走らせて…。